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文章目錄
- 介紹
- 加載R包
- 導入數(shù)據(jù)
- 數(shù)據(jù)預處理
- 畫圖
- 修改圖形
- 導出數(shù)據(jù)
- 系統(tǒng)信息
介紹
熱圖結合樹結構展示聚類結果通常用于展示數(shù)據(jù)集中的模式和關系,這種圖形被稱為聚類熱圖或層次聚類熱圖。在這種圖中,熱圖部分顯示了數(shù)據(jù)矩陣的顏色編碼值,而樹結構(通常稱為樹狀圖或聚類樹)則顯示了數(shù)據(jù)點之間的層次關系。
在聚類熱圖中,行和/或列可以根據(jù)相似性或距離度量進行聚類。樹狀圖展示了這些聚類的層次結構,其中相似的數(shù)據(jù)點在樹狀圖中更接近,而不相似的數(shù)據(jù)點則更遠離。分支的長度通常與數(shù)據(jù)點之間的距離成正比,較長的分支表示較大的距離或較低的相似性,而較短的分支則表示較小的距離或較高的相似性。
通過這種圖形,可以直觀地識別數(shù)據(jù)中的模式,例如在基因表達數(shù)據(jù)中,可以識別出表達模式相似的基因或樣本群體。這有助于理解數(shù)據(jù)的內(nèi)在結構,發(fā)現(xiàn)潛在的關聯(lián),以及為進一步的分析提供線索。例如,在生物信息學中,系統(tǒng)發(fā)育樹與熱圖結合可以幫助理解不同物種間的進化關系,以及它們在進化過程中的基因表達變化。
加載R包
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