在 Linux 中使用?conda?安裝 BLAST 非常簡單。conda?是一個(gè)流行的包管理工具，可以輕松安裝和管理生物信息學(xué)工具，包括 BLAST。以下是具體步驟：

---

1. 確保已安裝 Conda

如果你還沒有安裝?conda，可以參考以下步驟安裝 Miniconda（輕量版的 Anaconda）：

下載并安裝 Miniconda

# 下載 Miniconda 安裝腳本
wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh# 運(yùn)行安裝腳本
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh# 按照提示完成安裝

激活 Conda

安裝完成后，激活 Conda：

source ~/.bashrc  # 或者 source ~/.zshrc（如果你使用 zsh）

---

2. 創(chuàng)建并激活一個(gè) Conda 環(huán)境（可選）

建議為 BLAST 創(chuàng)建一個(gè)獨(dú)立的環(huán)境，以避免依賴沖突：

# 創(chuàng)建一個(gè)新環(huán)境，命名為 blast_env（名字可以自定義）
conda create -n blast_env# 激活環(huán)境
conda activate blast_env

---

3. 安裝 BLAST

在激活的 Conda 環(huán)境中，使用以下命令安裝 BLAST：

conda install -c bioconda blast
-c bioconda?指定從 Bioconda 頻道安裝（Bioconda 是一個(gè)專門用于生物信息學(xué)工具的 Conda 頻道）。blast?是 BLAST 軟件包的名稱。

---

4. 驗(yàn)證安裝

安裝完成后，驗(yàn)證 BLAST 是否安裝成功：

blastn -version

如果安裝成功，會(huì)顯示 BLAST 的版本信息，例如：

blastn: 2.13.0+
Package: blast 2.13.0, build Oct 18 2022 11:13:43

---

5. 使用 BLAST

現(xiàn)在你可以使用 BLAST 工具（如?blastn、tblastn?等）進(jìn)行序列比對(duì)了。

---

6. 退出 Conda 環(huán)境（可選）

如果你創(chuàng)建了獨(dú)立的環(huán)境，使用以下命令退出：

conda deactivate

---

總結(jié)

通過 Conda 安裝 BLAST 非常簡單，只需幾行命令即可完成。Conda 還能幫助你管理不同版本的軟件和依賴，非常適合生物信息學(xué)分析。